Teoretické ústavy
- Anatomický ústav LF UK
- Fyziologický ústav LF UK
- Imunologický ústav LF UK
- Mikrobiologický ústav LF UK a UN Bratislava
- Ústav epidemiológie LF UK
- Ústav farmakológie a klinickej farmakológie LF UK
- Ústav histológie a embryológie LF UK
- Ústav hygieny LF UK
- Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky LF UK a UN Bratislava
- Ústav lekárskej fyziky a biofyziky LF UK
- Ústav lekárskej chémie, biochémie a klinickej biochémie LF UK
- Ústav lekárskej terminológie a cudzích jazykov
- Ústav medicínskeho vzdelávania a simulácií
- Ústav molekulárnej biomedicíny LF UK
- Ústav patologickej anatómie LF UK a UN Bratislava
- Ústav patologickej fyziológie LF UK
- Ústav sociálneho lekárstva a lekárskej etiky LF UK
- Ústav súdneho lekárstva LF UK
- Ústav telesnej výchovy a športu LF UK
- Ústav všeobecného lekárstva